تحتفظ وزارة الأوقاف المصرية بعدد من المخطوطات القرآنية الأثرية في المكتبة المركزية للمخطوطات الإسلامية في مسجد السيدة زينب(س) في العاصمة المصرية «القاهرة»، والتي تجمع المخطوطات الأثرية كافة التي كانت موجودة في مساجد مصر كافة ونقدم أبرز تلك المخطوطات التي تحتفظ بها وزارة الأوقاف المصرية وهي كالتالي:تحتفظ وزارة الأوقاف المصرية بعدد من المخطوطات القرآنية الأثرية في المكتبة المركزية للمخطوطات الإسلامية في مسجد السيدة زينب(س) في العاصمة المصرية «القاهرة»، والتي تجمع المخطوطات الأثرية كافة التي كانت موجودة في مساجد مصر كافة ونقدم أبرز تلك المخطوطات التي تحتفظ بها وزارة الأوقاف المصرية وهي كالتالي:• مصحف ثالث الخلفاء الراشدين «عثمان بن عفان» وهو أحد المصاحف الستة التي نسخت في عصره، وأرسلت أربعة منها إلى الأمصار وبقي اثنان بالمدينة، وكان محفوظا بمسجد الإمام الحسين(ع)، وعدد أوراقه 1087 من القطع الكبيرة، القياس 57×57 سنتيمترا، لون المداد بني داكن، والفواصل بين الصور ملونة، ونوع الخط كوفي بسيط، يرجع إلى القرن الأول الهجري.• مصحف الإمام علي بن أبي طالب(ع)؛ وكان محفوظا بالمسجد الحسيني، وتجليده قديم يرجع إلى العصر العثماني، وعدد أوراقه 504 من القطع الكبيرة، ولون المداد يميل إلى السواد، ونوع الخط كوفي بسيط يرجع إلى القرن الأول الهجري، ضبطت حروفه بنقط حمراء، والصفحة الأخيرة منه مكتوبة بخط ثلث مملوكي أضيفت في العصر المملوكي إلى المصحف.• مصحف تاريخي نادر يرجع تاريخه إلى القرن العاشر الهجري، وهو المصحف الذي تم العثور عليه مع بعض المخطوطات الأخرى بمكتبة مسجد «سيدي عطية أبو الريش» بدمنهور بمحافظة البحيرة والذي يمتاز بالجمع بين النص القرآني والتفسير وعلم القراءات، كما أنه ينفرد في الخاتمة بفهرس لحصر الحروف الأبجدية طبقًا لعددها في القرآن الكريم.• الجزء الأول من أطلس الأوقاف الخيرية والأهلية للوجه البحري، وهو الذي يوثق جميع أملاك الأوقاف في الوجه البحري.• بعض اللوحات الخطية لآيات قرآنية وأحاديث نبوية معلقة على أحد الحوائط: وتمَّ استقدام تلك اللوحات من المساجد وتولى قسم الترميم إعادة ترميمها بعد أن كانت متهالكة.
