تضاربت الروايات حول أسباب نفوق الاسماك تبعاً للتحقيقات التي صدرت عن منظمات عالمية ومحلية، اذ افصحت منظمة الصحة العالمية عن نتائج تحقيقاتها الخاصة بأسباب ظاهرة نفوق الاسماك في العراق، فيما بيّنت أن المياه ملوثة بمحتوى عالٍ من القولونيات والمعادن الثقيلة والامونيا بتركيز مرتفع.
بينما ردت وزارة الزراعة على ذلك بتفسير مغاير، إذ أكدت ان سبب النفوق هو تعفن الغلاصم وهو التهاب فطري يصيب الاسماك. وجاءت تلك التصريحات بعد القضاء على الأزمة بشكل كامل بحسب ما أكدته وزارة الزراعة، مبينة ان مركز التفقيس المركزي للاصبعيات السمكية لم يصب بأي أذى، فضلا عن عدم تسجيل أية اصابة في المفاقس الحكومية ما يعني إمكانية تعويض كمية الأسماك النافقة وبسهولة.
